연구지원서비스

진단과 예측으로 건강한 세상을 만듭니다.

Microarray : Affymetrix GeneChip

Affymetrix GeneChip 서비스

  • Microarray 회사 중에서 선두를 달리는 Affymetrix사의 GeneChip 분석서비스를 통해 Human, Mouse, Rat을 포함한 20여종 이상의 생물에 대한 대량의 유전자 발현분석(Gene expression)과 203종 생물에 대한 microRNA 분석서비스를 대행해 드리고 있습니다.
    2006년부터 대구지역에서 서비스를 제공해 온 오랜 경험과 기술력을 바탕으로 전문인력을 통한 실험디자인부터 publish 수준의 리포트까지 맞춤형의 토탈서비스를 제공해 드립니다.

분석서비스 과정

그림1. 분석서비스 과정
RNA preparation : 500ng~1ug의 total RNA
RNA QC
  • Agilent사의 Bioanalyzer 2100/ NanoDrop ND-2000 이용
  • 미량의 샘플(50~100ng total RNA)로도 정확한 QC 가능
  • Virtual gel image, 28S/18S ratio graph, OD 260/280 ratio, OD 260/230 ratio등의 quality 결과로 판단
Template 합성과 Dye labelling(Biotin)
Hybridization
Stain, Wash and Scanning
Data analysis

데이터 분석

기본 분석 : 전처리, 유의 유전자 선별
  • 전처리
    1. - Raw Data의 Quality에 대한 정보를 통계적 수치와 다양한 Plotting으로 제공
    2. - 입력 데이터를 추후 주요 분석에 사용될 데이터로 변환
    3. - 고객의 데이터에 최적화된 방법 적용

  • 유의 유전자 선별
    1. - 유의유전자(Differentially Expressed Gene: DEG)를 탐색하는 과정
    2. - 분석대상 그룹 사이에서 통계적으로 의미 있는 발현 차이를 보이는 유전자 선별
    3. - 기본적인 fold change에서부터 2-class 뿐만 아니라 Multi-class간 비교 가능

추가 분석 : Gene ontology 분석, Pathway 분석
  • Gene ontology 분석
    1. - 유의 유전자에 대한 생물학적 특성을 파악할 수 있는 주석 정보
    2. - Pie chart와 통계 알고리즘 분석 방법을 이용하여 유의 유전자에 해당 Go term이 얼마나 유의미한지를 판별 할 수 있는 분석 방법

  • Pathway 분석 : DAVID or KEGG
    1. - 유의 유전자 분석, 클러스터링 분석 등을 통해 추출된 유전자들을 적용하여 pathway 분석 적용
    2. - 특히, 유전자들간의 상호관련성은 KEGG 의 pathway 정보를 통해 분석 가능
    3. - 맵에서 시각화가 가능하기 때문에 통합적인 측면에서 유전자들간의 상호작용을 확인

Data mining & visualization

Paper support : GEO & MIAME submission, 논문 수준 report

서비스 종류

서비스종류
구분 종류 가격 (부가세 별도)
Gene 2.0 ST Array
  • Human
  • Mouse
  • Rat
₩ 650,000
  • Arabidopsis 외 23종
견적가
3’ Expression Array
  • Human
  • Mouse
  • Rat
견적가
  • Arabidopsis 외 31종
견적가
micro RNA
  • miRNA 4.0 Array
견적가

※ 샘플 추출부터 진행할 경우 추가 비용이 발생할 수 있으므로 미리 상담 받으십시오.

※ 수량에 따라 가격 할인을 적용받으실 수 있으므로 미리 상담 받으십시오.

샘플 준비

  • 최소농도 : 50ng/ul(권장농도 : 100ng/ul 이상)
  • 최소량 : 500ng(권장량 : 1ug 이상)
  • 최소농도와 최소량이 아닐 경우에도 실험 진행 가능하니 상담바랍니다.
  • RNA 추출부터 진행하시고자 할 경우 반드시 담당자와 미리 상담하시기 바랍니다.
  • 가까운 지역은 협의 후 직접 수거하거나, 택배 서비스를 이용바랍니다.
  • 타지역은 아이스박스를 사용하여 드라이아이스 또는 충분한 아이스팩을 넣으신 후 택배 착불로 보내주시면 됩니다.

분석 시간

  • 샘플과 시약(Array, Reagents) 수령한 날로부터 3주 이내

(주)디앤피바이오텍사업자번호 : 504-81-66110 / 통신판매업번호 : 2011-대구중구-2582 / 대표 : 이명훈

서울본사서울시 송파구 송파대로 167, B동 6층 B608호(문정동, 문정역 테라타워)
대구지사대구시 북구 호국로 807 (학정동) 칠곡경북대학교병원 1동 4층 암센터연구시설부 (우. 41404) / TEL. 053-252-5829 / FAX. 053-252-5830
© 2020 D&P BIOTECH Inc. All Rights Reserved.